中红外波段（2～10μm）的新型光纤激光的开发对生物医学应用非常重要。不同生物流体、软组织和硬组织的中红外吸收光谱显著不同。对于特定的激光手术，适当的中红外波长的选择将优化手术性能并消除附带伤害。
在医学领域，已经报道了使用硫系玻璃光纤应用在2～10μm的医疗自由电子激光操作的能量传递。在某些情况下，在6.1 μm和6.45 μm下的手术会比传统的Er:YAG激光在2.94 μm处的手术导致更少的变形组织和疤痕。
通过调整波长和通过硫系玻璃光纤传输到远处的激光功率，可能应用于更多材料和生物样品的激光加工。